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生物科学论文

葡萄WRKY家族蛋白在非生物胁迫中的功能讨论的论文

摘要:近些年,葡萄因具有较高的营养价值和经济价值,其产业发展迅速,其中鲜食葡萄产量居世界第一位,酿酒葡萄居世界第五位。我国很多地区,如山东的烟台和青岛、新疆玛纳斯、宁夏贺兰等,均具有种植葡萄得天独厚的自然条件,但日趋严重的干旱、土壤盐渍化、冷害
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  近些年,葡萄因具有较高的营养价值和经济价值,其产业发展迅速,其中鲜食葡萄产量居世界第一位,酿酒葡萄居世界第五位。我国很多地区,如山东的烟台和青岛、新疆玛纳斯、宁夏贺兰等,均具有种植葡萄得天独厚的自然条件,但日趋严重的干旱、土壤盐渍化、冷害等非生物胁迫逆境严重限制了这些地区的葡萄产业发展。在自然进化和人工杂交驯化育种过程中,为了个体的生长发育,也为了后代稳定的延续,筛选出许多具有多种胁迫耐性的品种来抵抗和适应其生长的逆境。如中国东北的野生山葡萄(Vitis amurensis Rupr.)具有较强的耐寒性,能耐受零下40℃-50℃的严寒,且冬季无需埋土就可以过冬。北美葡萄种群河岸葡萄(Vitisriparia Michaux)和沙地葡萄(Vitis rupestris Scheele)具有较好的抗旱性。

  1616C、贝达等砧木品种具有很好的耐盐性。这些抗性品种自身在结构、生理和分子等水平上表现出对胁迫的耐受性和适应性,如诱导胁迫耐性基因或者胁迫应答基因的表达,这种诱导又来源于对逆境因子的感知、一系列信号分子的转导和信号通路的传递。转录因子能与不同的非生物胁迫相关的响应基因的启动子相互结合,从而转录调控基因表达,诱导产生相应的生理和分子调节机制以应对胁迫。因此,转录因子在植物应对非生物胁迫中发挥的作用受到越来越多的关注。WRKY 转录因子是植物体内一类成员庞大的基因家族,在参与调控植物抗旱、耐盐、耐冷等非生物胁迫中的功能和作用机制受到科学研究者们越来越多的关注。1994 年Ishiguro 等从甘薯中分离得到第一个WRKY 基因SPF1,Rushton 等从欧芹中分离得到WRKY1、WRKY2 和WRKY3,发现这些基因N- 端都含有7 个保守的氨基酸残基WRKYGQR,因此将此类转录因子命名为WRKY。

  研究表明,七肽序列和锌指结构基序对于WRKY 转录因子结合下游基因启动子上的W-box(TTGAC)来说是至关重要的。WRKY 转录因子根据WRKY结构域的数量和锌指结构基序的特征分为3 个亚家族。第一个亚家族有2 个WRKY 结构域;第二个亚家族含有和第一个亚家族类似的Cys2-His2 模式的锌指基序C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H,同时含有一个WRKY 结构域如PcWRKY3、AfABF2 ;第三亚家族含有一个不同于上述两个亚家族的Cys2-His/CysCys2-His2 模式的锌指基序C-X7-C-X23-H-X1-C,并且有一个WRKY 结构域。目前研究发现WRKY家族成员在模式植物拟南芥中有74 个,黄瓜中有55 个,水稻中有109 个,高粱中有68 个,大豆中有197 个,葡萄中有59 个。本文将主要从葡萄WRKY 家族蛋白介绍、葡萄WRKY 转录因子分别在干旱、盐、冷胁迫中的功能研究进展和耐逆机制探讨等方面进行阐述,旨在解析WRKY 转录因子调控葡萄应对非生物胁迫的分子机制,为葡萄耐逆境培育提供理论指导。

  1 葡萄WRKY 家族蛋白的种类和研究进展

  人们对葡萄WRKY 家族基因的亚家族分类、主要表达部位和参与的功能等进行研究。最早对葡萄WRKY 家族蛋白进行生物信息学分析来自于北京大学生命科学学院罗静初研究团队和Velasco等,他们通过构建和更新植物转录因子数据库PlantTFDB 2.0,从49 个物种中挖掘了53 319 个转录因子基因家族,并对所有家族转录因子的基本信息、结构特征、进化分类和表达模式等进行了详细注释,其数据库收集到葡萄的WRKY 转录因子有98 个成员。2010 年辽宁师范大学侯和胜研究团队在全基因组测序的基础上,对葡萄基因组的WRKY 家族蛋白进行分析,同时去掉冗余序列,得到56 条葡萄WRKY 蛋白,通过电子表达谱分析表明葡萄WRKY基因在很多组织中,如芽、培养的细胞、花瓣、果实、花序、叶、花梗、根和莲中都有表达,并且不同的葡萄基因表达部位不同,表达量也各不相同。2014年河南农业大学冯建灿研究团队分析发现葡萄中有80 个WRKY,其中16 个参与水杨酸SA 介导的葡萄白腐病抵御过程。2014 年中科院植物研究所李绍华研究团队以欧亚种葡萄(Vitis vinifera L.)‘黑比诺’基因组序列为基础,根据拟南芥中基因编码的氨基酸序列和同源比对,重新对WRKY 基因家族进行鉴定得到59 个WRKY 家族成员,这些成员不均匀地分布在葡萄染色体上。根据结构域和系统进化分析将这59 个WRKY 蛋白分成了4 组,第Ⅰ组有12 个成员,均含有两个WRKY 结构域;第II 组有39 个成员,又分出5 个亚群;第III 组有6 个成员,含有一个WRKY 结构域,且锌指结构以HXC 结尾;第IV 组成员最少,只有2 个,缺少完整的锌指结构。另外,他们对欧亚种葡萄‘玫瑰香’(V. vinifera cv‘Muscat Hamburg’)的幼叶、成熟叶、卷须、茎尖、幼果、成果和根共7 种组织中的WRKY 家族基因进行了转录水平的检测,发现WRKY 家族成员广泛参与多种生物和非生物胁迫应答过程,表明WRKY 基因可能在葡萄整个生命周期以及各种胁迫应答过程都起着重要作用。同年,西北农林科技大学王西平研究团队也对葡萄WRKY 家族蛋白进行了系统分析,确定出59 个WRKY 成员,并将其分成了3 组。

  转录表达特性分析发现有4 个WRKY 基因在葡萄根或叶中有大量的表达,有55 个WRKY 不同水平上在至少响应一种非生物胁迫,有38 个响应霜霉病侵染,大部分基因在脱落酸(abscisic acid,ABA)和水杨酸(salicylic acid,SA)的处理后下调表达。目前葡萄中对WRKY 家族的研究主要停留在基因挖掘和转录表达模式分析上,克隆和功能分析的VvWRKY 基因仅有14 个,且对其功能研究主要集中在葡萄生长发育和生物胁迫方面。如Terrier 等[21]2005 年进行了葡萄浆果生长过程基因表达的研究,初步推测转录因子WRKY 家族在这其中发挥重要作用。刘新研究团队发现WRKY71 参与了硫化氢(hydrogen sulfide,H2S) 和过氧化氢(hydrogenperoxide,H2O2)介导的葡萄抗霜霉病过程。异源表达VpWRKY3 则能提高烟草对茄科雷尔式菌抵抗力,而葡萄WRKY 在非生物胁迫应答方面的功能研究仍比较少。

  2 葡萄WRKY 家族蛋白与干旱胁迫

  植物受到干旱胁迫时,其细胞膜系统通常最先受到伤害,体内活性氧代谢失衡,胞内物质如电解质、渗透调节物质外渗,导致细胞失水,最终导致植物脱水死亡。WRKY 家族蛋白参与植物抗旱的分子机制主要有:

  (1)作为转录因子通过调控干旱胁迫应答基因、植物抗旱信号通路基因和自身基因的表达来启动植物对干旱胁迫的应答。如水稻OsWRKY47 能够与钙结合蛋白CaBP 和富含半胱氨酸分泌蛋白CRRSP 基因启动子区的顺式作用元件(G/T)TTGACT 结合来启动干旱胁迫信号传递通路,正向调控水稻抗旱;金桔的FcWRKY70 通过与精氨酸脱氢酶FcADC 启动子区的W-Box 结合,以提高植物抗旱性。

  (2)与其他蛋白互作调控自身活性来控制干旱胁迫应答网络。水稻OsWRKY30 能与MAPKs 互作并被其磷酸化,参与调控抗旱过程。

  (3) 通过调控ABA 信号途径参与抗旱。如拟南芥AtWRKY1 能够与ABA 信号通路中基因MYB2、ABCG40、DREB1A 和ABI5 的启动子W-Box 结合调控气孔运动,从而抗旱;菊花中的CmWRKY1 通过下调PP2C、ABI1 和ABI2,上调PYL2、SnRK2.2、ABF4、MYB2、RAB18 和DREB1A 这些ABA 信号通路中的基因,参与菊花耐旱。葡萄WRKY 家族蛋白参与对干旱的响应,如葡萄辅酶因子蛋白VvVQ 能与多个VvWRKYs 结合响应干旱胁迫;2011 年Liu 等从‘北峰’葡萄品种中克隆得到一个大小为1 255 bp 的 WRKY11转录因子VvWRKY11,能够与AtRD29A 和 AtRD29B启动子的W-box 结合,从而提高拟南芥抵御甘露醇诱导的干旱胁迫能力。2013 年刘新研究团队从‘左优红’葡萄品种中克隆到两个受干旱胁迫强烈诱导表达基因VvWRKY18 和VvWRKY45,其中VvWRKY18大小为954 bp,属于第II 类WRKY 家族蛋白,在花、花芽和叶中的表达量较高;VvWRKY45 大小为2 514 bp,启动子含有响应ABA、赤霉素(gibberellicacid,GA)、茉莉酸(jasmonate acid,JA)顺式作用元件,在干旱胁迫6 h 时表达量上调10 倍。2016 年本研究室又从抗性葡萄品种‘Vidal Blanc’(Vidal256)中克隆到一个大小为1 095 bp 的多种逆境胁迫诱导表达基因VvWRKY30,该基因的表达能够增强大肠杆菌对干旱的耐受性,且异源表达拟南芥植株发现VvWRKY30 能通过减少气孔开度,减少地上部分的水分散失,同时提高渗透调节物质脯氨酸(proline,Pro)和可溶性糖含量维持自身的渗透平衡;通过提高超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、过氧化物酶(peroxidase,POD) 和过氧化氢酶(catalase,CAT)的活性来清除细胞内的活性氧,提高植株的耐旱性。

  3 葡萄WRKY 家族蛋白与盐胁迫

  土壤盐渍化影响植物的生长和发育。盐胁迫下,原有的离子平衡被打破,高浓度的Na+ 会破坏细胞膜的完整性,从而影响细胞膜的正常生理功能。其次,由于外界环境中盐分浓度过高,土壤的水势下降,造成植物吸水困难,甚至能引起植物体内水分的外渗,导致水分的亏损,从而对植物形成渗透胁迫。植物通过一系列的机制来应对盐胁迫,如调节离子平衡、合成渗透调节物质、激活抗氧化酶系统等。WRKY 家族蛋白通常以多个成员一起协同调控的方式参与这些途径响应盐胁迫。如棉花中有109 个WRKY,其中有28 个响应盐胁迫,且GhWRKY17、GhWRKY41 和GhWRKY104 通过降低丙二醛含量、提高抗氧化酶活性来提高植物的耐盐性[35,36];利用微阵列分析发现在拟南芥的根部有18 个WRKY 受到NaCl 诱导,其中过表达AtWRKY25和AtWRKY33 后能提高拟南芥的耐盐性。目前对葡萄WRKY 家族蛋白参与耐盐胁迫的研究比较少,主要集中在西北农林科技大学王跃进团队和青岛农业大学刘新团队。王跃进等从中国野生葡萄品种‘Baihe-35-1’中克隆得到3 个WRKY 基因,分别命名为VpWRKY1、VpWRKY2 和VpWRKY3,大小分别为1 157 bp、1 607 bp 和1 280bp。其中VpWRKY1 和VpWRKY2 的过表达拟南芥植株具有较好抗盐性,VpWRKY3 能提高转基因烟草的耐盐性。

  刘新等从‘左优红’葡萄品种中筛选到VvWRKY13、VvWRKY18 和 VvWRKY45,从‘VidalBlanc’葡萄品种中筛选到VvWRKY30 和VvWRKY54都能受盐胁迫大量诱导表达。其中VvWRKY30的过量表达能够增强大肠杆菌对盐的耐受性;盐胁迫下,VvWRKY30 异源表达拟南芥通过提高脯氨酸和可溶性糖含量、抗氧化酶如SOD、POD 和CAT的活性增强其耐盐性。另外,中国农业大学卢江研究团队从葡萄品种‘Noble’中克隆得到MrWRKY30,其基因序列与刘新研究室克隆得到的VvWRKY30 相似性为47.3%。MrWRKY30 在拟南芥中的超量表达通过ROS 途径提高了植物对盐胁迫的敏感性。

  4 葡萄WRKY 家族蛋白与冷胁迫

  植物体内WRKY 家族蛋白抗寒分子机制的研究主要是通过ABA 信号转导途径的双重抑制机制调控对低温的响应。如茶树中有50 个WRKY 家族基因,大部分都受冷胁迫诱导,其中CsWRKY2 通过调控ABA 信号通路参与植物抗冷。目前葡萄响应冷胁迫的分子机制还不清楚,主要通过杂交育种和越冬埋土技术来提高植物的抗寒性,但该方法耗时费力,无法满足目前葡萄产业需求。有报道,WRKY 家族蛋白在植物耐冷中发挥重要作用。2014 年,李绍华研究团队完成了欧亚种葡萄‘玫瑰香’(V. vinifera cv‘Muscat Hamburg’) 和山葡萄(V. amurensis Rupr.)整个WRKY 家族成员在冷胁迫下的表达变化分析和比较研究,获得15 个冷胁迫相关的WRKY 基因,其中过表达WRKY28 和WRKY43 的转基因植株耐寒能力增加。卢江团队从葡萄品种‘Noble’中克隆的MrWRKY30 通过诱导拟南芥抗寒基因CBF1、CBF3、COR47 和ICE1 的表达,增强了转基因拟南芥的耐寒性。此外,从中国野生葡萄中克隆得到的VpWRKY1 和VpWRKY2 过表达拟南芥植株具有较好抗冷性。

  5 展望

  干旱、盐渍和低温等非生物胁迫是限制葡萄产业发展的重要问题,探究葡萄在非生物胁迫条件下的应答机理,对于筛选和培育抗性优良品种,提高葡萄产量具有重要的理论意义。植物对逆境胁迫的响应是一个复杂的信号传导过程,包括胁迫信号的感知、信号的转导、不同的生理和代谢反应的激活。作为植物最大的转录因子成员之一的WRKY 家族,它们在植物应答非生物胁迫中发挥着至关重要的作用,是逆境胁迫信号转导通路中控制基因表达的关键节点。WRKY 转录因子通常与其他蛋白或者顺式作用元件结合而发挥其功能。目前的研究发现WRKY 能够与MAPKs、CDPKs 等蛋白酶结合,从而激活或者抑制其自身的活性,进而调控与胁迫相关基因的启动子区W-Box 的结合,来参与植物对非生物胁迫的应答。另外,不同的激素如SA、ABA 等及气体信号物质一氧化氮(nitric oxide,NO)、H2S、H2O2 均可作为信号分子参与植物应答逆境胁迫的过程。如干旱、盐和冷胁迫都能启动ABA 信号通路,响应并传递胁迫信号。有研究表明,ABA 诱导表达的基因参与非生物胁迫应答也依赖于MAPKs、CDPKs 等的活性。因此,对于WRKY 家族蛋白参与葡萄耐逆的分子机制研究可以从分析葡萄WRKY结合的伴侣蛋白、调控的下游基因、协同的信号分子通路等方面着手,综合探究葡萄WRKY 抗逆的调控网络。此外,近年来WRKY 家族蛋白在基因转录过程的负调控作用也得到了广泛关注,如水稻WRKY13 作为转录抑制子,结合并抑制下游干旱响应基因SNAC1 的转录,从而使转基因水稻表现出干旱敏感症状;拟南芥WRKY70 在防御反应中通过激活水杨酸响应基因,抑制茉莉酸响应基因,从而平衡互相拮抗的信号通路;但是目前尚未有葡萄中发挥负调控作用相关WRKY 蛋白的报道,这可能为进一步丰富并完善葡萄WRKY 抗逆调控网络提供一定思路。

  作为功能强大的基因家族,同一个WRKY 转录因子往往参与多种抗逆过程。如从葡萄品种‘Noble’ 中克隆的MrWRKY30 即增强了转基因拟南芥的耐寒性,同时提高了转基因南芥对霜霉菌的抗性;从‘Vidal Blanc’葡萄品种中筛选到的VvWRKY30 提高了植物的耐盐和耐旱能力;从野生葡萄中克隆的VpWRKY2 同时提高了植物对盐胁迫、冷胁迫和霜霉病害的抗性。

  通过基因工程手段将这些WRKY基因导入葡萄,培育和筛选出同时具有多种胁迫耐受性的新品种,对推动葡萄产业经济的发展具有重要的理论及实践意义,同时利用生物措施改良土地,对于改善我国土地生态系统和提高土地资源利用率具有重要意义。

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